随着时间的推移，宗教发展越来越完善，从多神崇拜到一神宗教。还有和宗教基本同时诞生的哲学(关于这一点，到底是神学源于哲学还是哲学源于神学，亦或是两者的起源各不相干，只是后来连接紧密。还是神学高于哲学，哲学高于神学，这类烦心问题就懒得钻研考证了，这里就暂认为两者起源各不相干，而后来相互影响吧)，虽然这些的发展几乎照亮了人类思维和精神的全部空间，但仍有些无法照到的阴影，而之前的巫术和自然崇拜就藏匿于这些地方。哲学-神学的体系仍有达不到的地方，在这些达不到地方里，就是神秘学的领地。而关于巫术、自然崇拜的理论与研究就在这块领地里发展着。其研究也越来越理论化，体系化。魔法就在这时出现。而研究和总结这些的人，我们姑且称他们为魔法师。这些人总结了前人的理论、思想、仪式。经过加工形成更为复杂的理论体系——魔法。更出现了魔法阵、专门的咒语之类的东西。魔法发展的一产物就是炼金术。在充满宗教迫害的黑暗中世纪，神秘学的魔法自然也受到了影响。这一影响的表现就是在中世纪算撰写的诸多魔法书籍（Grimoire）：《所罗门的钥匙》（The Key of Solomon） 、《所罗门的小钥匙》（Lemegeton） 、《罗洁爱尔之书》（The Book of Raziel） 、《大魔法书》（Grand Grimoire） 、《魔法大全》（Heptameron） 中所表现出的恶魔学、召唤、天使、所罗门王、亚当、伊甸园这些乱踢八糟的玩意。里面充斥着不少基督教的元素。（或者这些书籍可以看做是整个中世纪神秘学的大杂烩）。